姨妈肛门疼痛的原因有很多，如下:

1.可能是盆腔内积液较多，引起盆腔炎，并伴有小腹疼痛等症状。

2.可能是子宫内膜异位症引起的，每次来月经都会伴有痛经，而且痛经会逐渐加重。可以在医生的指导下进行药物和理疗治疗。

3.如果有痔疮、肛裂、肛瘘、溃疡性结肠炎、肠肿瘤、结肠息肉等肛肠疾病，也会引起肛门疼痛。

经期多休息，腹部保暖，喝点红糖水。