1.上消化道出血是晚期患者的重要并发症，发病率约为10%。大部分出血部位是食管下段和胃底部的冠状静脉。常由机械损伤、过度用力等诱发。表现为呕血、黑便，出血量一般较大。

2.晚期肝性脑病并发肝性脑病的患者多为腹水型。由大出血、大量腹水、利尿过度诱发。

3.感染易并发感染，如病毒性肝炎、伤寒、腹膜炎、沙门氏菌感染、阑尾炎等。，由于患者的低白蛋白血症、门静脉高压等。

4.肠道并发症:血吸虫病引起的肠腔狭窄严重的结肠病变可并发不完全性肠梗阻，特别是乙状结肠和直肠。血吸虫病人的结肠肉芽肿可并发结肠癌。多为低恶性腺癌。