肛门肿痛的原因有很多，如下:

首先排除是否有肛周脓肿或直肠黏膜下脓肿。

其次，排除是否痔疮已经滑出，或者外痔部分有水肿和血栓形成。

再者，排除是否有炎症性肠病或肛窦炎。

建议患者先去肛肠科。一般可通过肛门局部检查、肛门指诊、肛门镜检查作出初步诊断。明确诊断后，针对症状原因进行及时治疗。如果是肛周脓肿等感染性疾病引起的，主要治疗方法是手术。如果是因为痔疮，可以先用药物保守治疗。