它是一种早期无痛性阴囊肿块，呈疣状或丘疹样，可呈菜花状，质地坚硬。肿瘤的生长速度因人而异，有的可以多年变化不大，突然长得更快。肿瘤中心可出现坏死、溃疡，感染时伴有脓血、臭味和局部疼痛。超过50%的患者在治疗时有同侧腹股沟淋巴结肿大。晚期肿瘤可侵犯阴茎和阴囊，引起血行转移。一般症状不明显。

诊断主要依据临床表现，但需要注意的是，患者在皮疹出现前可能有数月或数年的局限性阴囊瘙痒或烧灼感史。医生应充分警惕慢性阴囊湿疹、皮炎和溃疡。考虑到阴囊癌的可能性，局部组织病理学活检是最有力的诊断。对于肿胀的腹股沟淋巴结，也应进行活检，以确认它是否是炎症性的或确实是转移性的。虽然阴囊癌转移至腹膜后淋巴结罕见，但一旦可疑，应使用b超、CT、MRI和细针穿刺活检帮助诊断和明确分期。

在阴囊癌的诊断中仍然缺乏特异性和敏感性的肿瘤标记物。然而，近年来，免疫组化和分子生物学诊断技术已被应用于阴囊癌的诊断和预后，以及发病与人乳头瘤病毒(HPV16)的关系等。)也在关注和研究中。如国内已采用免疫组织化学方法检测癌基因ras产物p21蛋白在阴囊癌、癌旁组织和正常组织中的表达。已证明与病理分级、分期呈正相关，可作为诊断阴囊癌早期复发转移和估计预后的指标。又如在HPV16型阳性的阴囊癌患者中发现的肿瘤抑制基因TP53的累积突变，P16INK4A和P15INK4B的纯合遗传性丢失，可作为肿瘤标志物估计阴囊癌的预后(嘎兰，1999)。