肛门疼痛的原因如下:

首先要考虑是否存在肛周感染、脓性的疾病，比如可能有肛周脓肿或直肠黏膜下脓肿。

其次，如果肛门周围有皮脂腺或毛囊感染，也可出现肛门疼痛的症状。

再者，考虑到肛裂的情况，如果肛裂的裂口较深，肛门括约肌暴露，也可产生肛门疼痛的症状。

此外，如果发生痔疮脱垂，在恢复不及时的情况下，还可能出现水肿、血栓和肛门疼痛。

最后，如果外痔发炎，也会出现肛门疼痛不适的症状。

这种情况可以先去肛肠科检查。诊断明确后，可以主要用药物或手术治疗。