肛瘘对身体的主要危害有:

一是脓的分泌物多，所以肛门周围的脓会污染内衣，还会引起肛门周围的皮炎或湿疹。

二、肛瘘形成后，肛门周围的肿块会引起疼痛。肛瘘和肛周脓肿是不同时期的同一疾病。肛瘘可随时引起脓肿、肛门肿痛或流脓。

第三，由于肛瘘反复发作，脓液穿透管壁，沿括约肌扩散，引起肛瘘越来越复杂，使病情越来越复杂，难以治愈。复杂性肛瘘，尤其是部分上括约肌瘘或外瘘的肛瘘，反复复发，不易治愈，既费钱又痛苦。

第四，肛瘘反复发作会刺激肠壁，导致癌变，所以是影响生活的疾病。