肛门疼痛被认为是由肛周脓肿、血栓性外痔和肛窦炎引起的。

肛周脓肿较为常见，主要是细菌感染导致脓疱肿胀，局部发炎，刺激肛门，引起疼痛。

血栓性外痔，由于局部血液循环不良，表现为肛门疼痛难忍，皮下出现小血栓，导致肛门胀痛。

肛窦炎患者也会出现肛门疼痛，主要是由于肛窦内细菌感染，局部红肿、充血所致。通过肛门指诊和肛门内窥镜检查可以做出明确的诊断。