肛门上的水疱可能是由以下疾病引起的。

1.病毒感染:比如单纯疱疹，单纯疱疹病毒在肛门局部感染可引起局部水疱。

2.过敏:肛门内的皮肤接触致敏物质后，容易引起皮肤过敏，从而出现水泡。

3.肛周脓肿:主要见于颜色较深的脓性水疱，主要由感染引起，通常伴有发热、疼痛等症状。

当肛门出现水泡症状时，建议不要私自用药。应及时到医院进行相关检查，明确具体病因后在医生指导下采取治疗措施。