包括生物医学因素和社会心理及文化原因。前者是指大脑在发育过程中(产前和围产期)受到的各种不利因素，可使大脑的发育达不到应有的水平，最终影响智力。后者是指文化剥夺、教育不当、感觉剥夺等因素，可使获得的信息输入不足或不恰当，从而影响智力水平。根据1985年世卫组织分类和全国协作组的调查结果，其成因分为以下几种类型。

1.感染和中毒占12.3%。指出感染前后的脑部感染，如风疹、巨细胞病毒、弓形虫、单纯疱疹病毒等病毒感染。中毒包括高胆红素血症、毒血症、铅中毒、酒精中毒和长期过量服用苯妥英钠或苯巴比妥。

2.脑机械损伤和缺氧占19.6%。脑损伤可由分娩前、分娩后及分娩过程中的物理或机械因素引起，如产伤、颅脑外伤等。或者围产期缺血缺氧也可损伤脑组织，如孕妇严重失血、贫血、心力衰竭、肺部疾病、新生儿窒息、颅内出血等。，以及溺水后的脑缺氧、麻醉意外和持续性癫痫发作。

3.代谢、营养、内分泌疾病占5.8%。体内氨基酸、碳水化合物、脂肪、粘多糖、嘌呤和其他物质的代谢障碍会影响神经细胞的发育和功能，如苯丙酮尿症和半乳糖血症。出生前后营养不足，特别是蛋白质、铁等物质的缺乏，会使胎儿和婴儿的脑细胞数量减少或功能降低。内分泌疾病也会影响智力发育，比如甲状腺功能减退。

4.粗脑疾病占0.7%。包括肿瘤、不明退行性疾病、皮神经综合征、脑血管疾病等。

5.大脑先天畸形或遗传综合征占9.5%。先天性畸形包括脑积水、脑积水、小头畸形、神经管功能不全和脑畸形。肾上腺脑白质营养不良等遗传综合征。

6.染色体畸变占5.1%。染色体畸变包括常染色体或性染色体的数量或结构改变，如先天性愚型、18三体综合征、C三体综合征、喵喵叫综合征、脆性X综合征、先天性睾丸发育不全综合征和先天性卵巢发育不全综合征。

7.其他围产期因素占11.8%。包括早产儿、低出生体重儿、宫内发育迟缓、母体营养性疾病、妊娠高血压等。

8、伴有精神疾病如婴儿孤独症、儿童精神分裂症。

9.社会心理因素占8.2%。此类儿童无器质性脑损害，主要由神经心理损害、感觉剥夺等不良环境因素引起，如严重缺乏早期适当的刺激和教育。

10.特殊感官缺陷占5.1%。包括聋、哑、盲等特殊感官缺陷。

11.不明原因占21.9%。经过详细检查，如果找不到病因线索，病因不明。