主动脉夹层术后并发症主要取决于主动脉夹层的类型。主动脉夹层的类型决定了主动脉夹层的手术方式。

如果B型主要涉及介入治疗和腔内隔绝术，主要并发症是所谓的主动脉带膜支架植入综合征，主要表现为发热、胸痛、血沉增高。

如果是A型夹层，体外循环下的手术会有相对复杂的并发症。体外循环心内直视手术有一系列并发症，神经系统并发症，还有一系列涉及胃肠道、肝脏、肾脏的并发症。

因为主动脉供应全身的血管，当血液供应出现问题时，相应的器官就会功能障碍甚至坏死，因此可能出现神经系统和呼吸系统的并发症，肾功能衰竭，肝功能不全，甚至消化道出血。