此病应与下列疾病相鉴别。

1.扁桃体角化病是扁桃体隐窝口部上皮细胞过度角化，呈黄白色角状或尖锐的沙状角化物质。摸起来很硬，粉底很牢固，擦不掉。无明显自觉症状，或有咽部不适或异物感的感觉。可同时发生于咽后壁、咽旁道和舌根。病程较长，多发生于30岁以下的年轻人。病因不明确，一般不需要特殊处理。

2.如果扁桃体肿瘤一侧扁桃体迅速肿大或扁桃体肿大并有溃疡，应考虑肿瘤的可能性。比如扁桃体肉瘤，早期可局限于扁桃体的黏膜下层，表面光滑。其主要症状是一侧扁桃体迅速肿大，常有颈部淋巴结转移，尤其是年轻人。活检可以确诊。

3.症状性扁桃体肥大是一些全身性疾病的局部表现。比如患白血病时，扁桃体可以对称肿大。有时咽部症状可能是首发症状。根据外周血象和骨髓像作出诊断。