小儿针灸一般不会有什么副作用。但是，在小儿针灸的过程中，有一些特殊的注意事项。

在对儿童进行针灸时，医生应集中精力，控制针灸，以免在儿童哭闹、挣扎时造成不必要的伤害。孩子家长要采取适当的姿势，固定好孩子的身体，避免孩子在坐立不安和挣扎的过程中造成不必要的伤害。

此外，由于小儿囟门尚未闭合，头顶穴位不易针刺。儿童易患一些皮肤癣菌病、皮疹或奶疹。如果皮肤溃烂或溃烂，就不能扎。

对于胸腹部和腰背部的位置，在针刺的过程中，不宜直刺深刺，以免损伤器官。针刺眼颈部的风府、哑门穴、风池穴等穴位时，要注意一定的角度，以免伤及重要器官。对于尿潴留、遗尿的患儿，针刺腹部输血时要适当注意角度和方向。