跑步脚背疼痛的主要原因如下:

首先，如果跑步可能导致脚部乳酸堆积，会引起脚背疼痛，活动后疼痛症状加重。

其次，长时间跑步可能会引起筋膜炎，发病时也会出现脚痛的症状。

再者，跑步时，脚扭伤还会引起脚背疼痛，脚背水肿明显，活动受限。

另外，当脚背疼痛剧烈时，建议患者及时就诊，在医生的指导下进行对症治疗。