女性小便后肚子疼的原因主要有以下几点:

1.尿路感染:主要由炎症感染引起，患者可出现膀胱刺激症状，如尿频、尿急、尿痛，并伴有排尿后胃痛。

2.急性盆腔炎:患者临床表现为白带异常，腰腹部疼痛，排尿后小腹疼痛。

3.尿路结石:与尿路梗阻有关，剧烈活动时可引起疾病发作。患者表现为腹痛、血尿、排尿后腹部隐痛。

4.阑尾炎:与细菌感染密切相关。发作时可出现排尿后腹痛，严重者可出现全身性高热。