反流性食管炎常与以下疾病混淆:

1.食道癌可以通过食管镜检查和X线吞钡检查来鉴别。

2.消化性溃疡常为慢性、节律性、季节性、周期性，X线钡餐和胃镜检查可见于胃或十二指肠球部。

3.心绞痛和食管炎的胸骨后疼痛和心绞痛可单独存在，有时可同时存在，并可通过硝酸甘油等缓解。，所以很难区分它们。

4.癔病球是指患者主诉喉部有异物感，无法开始吞咽，有堵塞感。临床检查未发现器质性病变。认为是胃高反流引起的上食管刺激所致，有时是少数患者的唯一症状，导致误诊。