莱姆病的临床特征与其他螺旋体相同，通常分期发作，缓解与发作交替。潜伏期3 ~ 32天，平均7天左右。

临床表现多种多样，可分为三个阶段。早期临床表现包括I期和II期。

I期主要表现为全身感染症状(发热、头痛、恶心、呕吐和局部淋巴结肿大)和特征性皮肤损害(慢性游走性红斑)。

在大多数病例中发现皮肤的慢性游走性红斑。起初被蜱叮咬的部位常出现红斑或丘疹，逐渐扩大形成环状，平均直径15cm。中心稍有硬化，周围红色边界不清。病变是一处或多处。多见于大腿、腹股沟、腋窝。局部可能会有烧灼感和瘙痒感。

起初，该病常伴有疲劳、寒战、发热、头痛、恶心、呕吐、关节和肌肉疼痛或脑膜刺激等症状。并且局部淋巴结可以增大。偶尔出现脾肿大、肝炎、咽炎、结膜炎、虹膜炎或睾丸肿胀。皮损一般持续3 ~ 8周。

第二阶段是疾病发作后的几周或几个月。分别约有15%和8%的患者有明显的神经系统症状和心脏受累体征。

神经系统可表现为脑膜炎、脑炎、舞蹈病、小脑性共济失调、脑脊髓炎、运动和感觉神经根炎和脊髓炎，但脑膜炎、脑脊髓炎和神经根炎更常见。这些病变可能会复发，偶尔会发展成痴呆和人格障碍。

少数病例皮损后3 ~ 10周出现不同程度的心脏损害如房室传导阻滞、心肌炎、心包炎、左心室功能不全等。心脏损伤通常只持续几周，但可能会复发。

在III期感染后的几周至两年内，约80%的患者出现不同程度的关节症状，如关节痛、关节炎或慢性糜烂性滑膜炎。膝、肘、髋等大关节常见，小关节周围组织也可受累。主要症状是关节疼痛和肿胀，膝关节可能有少量积液。反复发作时，少数患者的大关节病变可变为慢性，并伴有软骨和骨组织的破坏。

在这个阶段，少数患者可能出现慢性神经系统损害和慢性萎缩性肢端皮炎的症状。有些患者还可能有精神障碍。

眼部损害的病例，早期表现为结膜炎，后期主要为葡萄膜炎、视神经炎、虹膜睫状体炎、角膜炎。这一阶段通常始于病后2个月或更长时间，持续数月至数年。

CDC对莱姆病的诊断标准包括以下五项(拉恩，1991):

1.有慢性游走性红斑。

2.短暂或反复发作的不对称关节肿胀和关节炎、淋巴细胞性脑膜炎、颅神经根炎(特别是面瘫，可为双侧)、神经根炎、脑脊髓炎(因脑脊液中特异性抗体滴度大于血清滴度而确诊BB感染)；急性发作的短暂性高房室传导阻滞。

3.流行病学暴露史是指发病前30天内潜在的蜱类栖息地，如树林、灌木丛或草地。

4.去过疫区是指该地区过去至少有2例莱姆病确诊病例，或有蜱叮咬史者显示有BB感染的血清学证据。

5.实验室检查显示从感染组织或体液中分离出莱姆病螺旋体，或在血清和脑脊液中检测到高滴度特异性抗体，或双份血清特异性抗体滴度升高，排除梅毒和已知引起假阳性的生物学原因。

莱姆病可通过以上五项中的三项或三项以上来诊断。