在克罗恩病活动期，应口服以下药物:一是柳氮磺胺吡啶；

第二，糖皮质激素；

三是免疫抑制剂，如硫唑嘌呤。这些药物适用于激素治疗无效或依赖激素的患者。加入这些药物后，激素的用量可以逐渐减少；

四是抗菌药物，如喹诺酮类、甲硝唑；

第五，生物制剂，如英夫利昔单抗，应用广泛，治疗效果好。

其次需要对症治疗，比如纠正水电解质的紊乱。贫血患者可接受输血，低蛋白血症患者可接受血清白蛋白，腹痛腹泻患者可酌情使用抗胆碱能药物或止泻药。如果药物治疗效果不好，或者已经发生并发症，如完全性肠梗阻、急性穿孔等。，需要手术。