迄今为止，IgA肾病的病因仍不清楚，可称为一种原发性肾脏疾病。多年来，已经找到了一些原因:

1.有遗传背景。IgA肾病患者可以看到家族聚集现象，即家族中有多人患有IgA肾病，提示其有遗传背景。

2.感染。尤其是黏膜感染，如慢性扁桃体炎，容易出现蛋白尿和血尿。或者慢性扁桃体炎。如果进行慢性扁桃体切除术，当天可能出现严重的蛋白尿和血尿，称为刺激。这进一步证实了慢性黏膜感染很可能是原因之一。

3.慢性和炎症性肠病。如溃疡性结肠炎，如克罗恩病。发现克罗恩病在回盲部手术后可随IgA肾病缓解，这意味着两种疾病可能是同源的，即回盲部淋巴组织异常，产生难以分解的IgA1。IgA1产生，在体内积聚，沉积在肾脏，引起炎症反应。局部释放激素，如在回盲部，可以治疗和缓解IgA肾病，在一定程度上认为病因在于淋巴结。