溃疡性结肠炎是一种常见病和疑难病。目前其病因不明。目前，世界各地的研究结果认为溃疡性结肠炎是一种自身免疫性疾病，也就是说，它具有局部肠道症状和全身免疫紊乱。

首先要考虑患者的免疫状况。溃疡性结肠炎患者会出现体液免疫和细胞免疫的紊乱。发作期属于体液免疫功能亢进，缓解期属于细胞免疫功能减退。

其次，有研究认为溃疡性结肠炎具有一定的遗传性，也就是说，具有一定的家族性。

第三，溃疡性结肠炎与饮食密切相关。比如前30年，中国很少有这种病的患者。为什么这几年这么多？国内著名的粘连性肠病专家欧阳勤教授提到，随着一些国外饮食的引入，如麦当劳、肯德基等，国外的很多疾病也传入了中国，溃疡性结肠炎就是其中之一。研究表明，这种高热量、高蛋白的饮食会产生很多有害物质，如乙酰谷氨酰胺等，对肠黏膜造成一定的损害。还有一点要注意的是感染因素，特别要提醒广大患者和听众的是，溃疡性结肠炎是一种非特异性炎症，也就是说，它不是由炎症引起的，但是炎症在溃疡性结肠炎的发病过程中起着一定的作用。肠道不是无菌的，但是有益菌群很多。当溃疡性结肠炎爆发时，国外其他学者的研究表明，这些有益菌群会变成有害菌群，进而成为侵入肠黏膜的有害因素。对于其他因素，如自由基或细胞凋亡，这些因素可能是溃疡性结肠炎的常见原因。