甲硝唑在临床上主要用于治疗和预防厌氧菌感染，如腹腔、女性生殖系统和下呼吸道、皮肤软组织、骨骼和关节等。

对由抗生素引起的败血症、心内膜炎、脑膜感染和结肠炎也有效，并用于治疗破伤风感染。也可用于口腔厌氧菌感染。

甲硝唑在临床应用时，存在一些不良副作用，主要包括胃肠道不适。许多人在使用厌氧菌后会出现胃肠道症状。

包括胃肠道疼痛、恶心、呕吐、食欲不振、头痛、头晕等神经系统症状，偶尔出现感觉异常和肢体麻木。

其次，甲硝唑主要由肝脏代谢，所以如果肝功能不全的患者使用，可能会加重肝功能的一种异常。因此，在使用它时，我们应该监测患者的肝功能。