B型流感嗜血杆菌感染可刺激机体产生保护性抗体，但持续时间短，因此疫苗的改进成为近年来的重要课题。目前，使用以下三种疫苗:

1.荚膜多糖疫苗(PRP)疫苗无蛋白质成分，为半抗原，能刺激机体产生IgM抗体，但不能刺激辅助性T淋巴细胞的活化，因此不放大免疫和召回反应，持续时间短。

2.多糖-载体蛋白结合疫苗是将荚膜多糖抗原与载体蛋白(常用白喉或破伤风类毒素)结合在一起，增强免疫原性，加强机体的免疫反应，具有持久的回忆反应。应用于1 ~ 18个月的婴儿，效果为80% ~ 90%。

3.荚膜寡糖变体白喉类毒素结合疫苗彼此共价结合。目前认为该疫苗具有较强的免疫原性和安全性，有效率可达百分之九十七。

因为尼古丁是流感嗜血杆菌的营养成分，所以戒烟是成年人预防这种疾病的措施之一。避免抗生素的滥用，防止耐药菌株的出现也是重要的预防措施，临床医生尤其要注意。