胃旁路手术会有相关的并发症，也就是常说的副作用。长期的副作用就是术后营养相关的并发症，就是术后对一些维生素和微量元素的吸收会受到阻碍。

首先，远端的胃和十二指肠容易出现维生素B12、叶酸和铁吸收障碍。

由于大量小肠被搁置，容易出现营养物质的吸收障碍、贫血和微量元素缺乏，有些严重的并发症甚至难以纠正。

应鼓励患者术后定期随访，同时改变生活方式。随访期间应注意营养不良的防治。