1.阴茎梅毒:阴茎头和包皮处无痛性溃疡，肉芽呈紫色，边缘高而硬，类似阴茎癌的早期表现。但有冶炼和游泳史，血清梅毒螺旋体血凝试验TPHA试验阳性，溃疡分泌物暗视野检查可检出梅毒螺旋体。

2.阴茎结核多位于阴茎头、系带和外尿道口。约2/3的溃疡开始边缘清晰，溃疡底部覆盖一层奶酪状坏死组织，下面有新鲜肉芽组织。约1/3开始为结核结节，逐渐发展为溃疡，部分可形成瘘管。如果病变涉及阴茎海绵体并出现纤维性疤痕，阴茎会弯曲。分泌物涂片、培养或动物接种、结核分枝杆菌检测或结核局部活检。

3.阴茎阿米巴病。阴茎头溃疡，表面出血，分泌物多，可误诊为早期阴茎癌。但溃疡渗出物和局部活检可发现阿米巴原虫和阿米巴囊肿。

4.下疳的病原体是杜克雷链球菌，通过不洁性交感染。常发生于阴茎头或会阴处，开始为红色小丘疹，后转为脓肿，扩大破裂，形成椭圆形或圆形溃疡，深浅不一，轻度压痛，严重者阴茎坏死。腹股沟淋巴结可能会肿胀、疼痛、化脓和溃烂。杜克雷疫苗皮试阳性，直接涂片或分泌物培养可检出杜克雷细菌。

5.凯拉增生性红斑阴茎头和包皮以深红色圆形斑块、硬结或溃疡为特征，常被误认为阴茎癌癌前病变。但病理检查显示表皮棘细胞增生不良，淋巴细胞渗入真皮。

6.阴茎鲍恩氏病是阴茎头部出现鳞屑性丘疹或红色鳞屑性斑点，边界清楚，或为浅表性溃疡和阴茎癌，早期不易分辨。连续切片组织病理学检查显示皮内期鳞状细胞癌为鲍恩氏病，而阴茎鳞状细胞癌侵犯真皮。

7.阴茎角化在阴茎角化的早期，阴茎头上出现硬结，逐渐长大脱皮，但不断裂。组织病理学检查显示乳头状鳞状细胞团，许多棘细胞和基底膜肥大。

8.阴茎尖锐湿疣。病毒感染阴茎冠状沟后上皮细胞增生引起的瘤样病变可形成溃疡，与阴茎癌早期相混淆。但组织病理学检查显示上皮呈乳头状增生，表皮向下延伸，棘细胞层增厚，并有许多有丝分裂。但没有细胞的不典型和多形性生长，更不用说侵袭性生长了。

9.阴茎乳头状瘤:该病是一种常见的阴茎良性肿瘤。开始是局部小隆起，逐渐增大为乳头状，有蒂或无柄，红色或淡红，质软，生长缓慢。二次感染者可能有恶臭分泌物，容易被误认为阴茎癌。可以通过活组织检查进行鉴定。

10.阴茎角:是一种慢性增生性疾病。局部突起呈条状、柱状生长，灰褐色或黄色，边缘清晰，或干硬如角，或头尖缩。虽然有增生性组织改变，但没有癌细胞生长，这可以通过疾病检查来确定。

11.阴茎硬皮病:该病多发生于阴茎海绵体，主要表现为局部纤维结节。肿瘤虽然坚韧，边界不清，但硬度较差，生长较慢，表面光滑，活跃，很少形成溃疡和腹股沟淋巴结肿大。和阴茎癌不难区分。