西医治疗甲亢用的药物都有一定的副作用，不同的药物有不同的不良反应。主要反应有:

1.引起白细胞减少:如咪唑、他巴唑、甲巯咪唑。

2.引起肝、肾功能损害:严重肝、肾功能衰竭或微活动性肺结核者禁用。

3.甲减，甚至永久性甲减:主要见于接受放射性碘131治疗的患者，因为碘131被甲状腺摄入后会释放射线，破坏甲状腺组织细胞。用药期间要定期检查血象、肝肾功能、甲状腺功能。