中风后遗症的治疗主要是二级预防，防止其复发。根据缺血性卒中或出血性卒中，出血性卒中主要是控制血压和治疗动脉瘤。缺血性中风通过抗血小板、抗凝或降低血压和血脂来治疗。

中风后遗症的药物治疗以二级预防为主，其他治疗根据不同时间以康复治疗为主。康复包括物理治疗、针灸治疗、电疗等。物理治疗还包括经颅磁刺激、中频等治疗。

针灸是对我们身体的穴位进行治疗，其中一些穴位是通过电刺激的。从机理上，刺激了一些点。从机理上讲，刺激人体后，身体会分泌一些化学物质，促进脑细胞的恢复。

还有一些体育锻炼。目前国内外包括香港都有这种方法的治疗和相应的研究。多数研究证明，针刺能改善中风后后遗症，可作为中风后遗症的辅助治疗手段。但也有研究认为，针灸对中风的疗效并未达到统计学差异，针灸的价值并不显著。