藿香正气水和藿香正气丸的区别在于功效不同，适合不同的人群。

第一，功效不同。藿香正气水有效成分含量高，用量小，见效快，可内服，也可外用。藿香正气丸作用持久，但由于是丸状，吸收慢，服用量大。

第二，适用人群不同。藿香正气水对婴儿湿疹、阴囊湿疹、带状疱疹、脚气有效，儿童可以使用。一般儿童很难服用藿香正气丸，所以适合成人服用。

建议患者根据自己的实际情况和病情程度用药，然后遵医嘱。