1.直接检查法在急性期，可用新鲜血液检查活性病原体，或用姬姆萨染色检查厚血涂片，或血液离心后检查血块中漂浮的上清液，寻找锥虫的鞭毛。组织活检也可用于发现假性囊肿中的鞭毛。

2.动物疫苗接种诊断的“黄金指数”。在疑似克鲁氏锥虫感染者吸血4 ~ 6周后，检查实验室培养虫的直肠可发现锥虫。这种方法非常特异，只要外周血中有极微量的锥虫，就可以确诊。

3.聚合酶链反应检测血液和组织中的克鲁氏锥虫特异性DNA片段。用这种方法，在10毫升血液中只能找到一个锥虫。和动物接种一样，这种方法的特异性高达100%，灵敏度也很高。它甚至可以取代动物疫苗，但它对晚期和慢性恰加斯病患者的敏感性并不理想。

4.血清试验是目前临床诊断的主要方法，可在感染者体内发现抗锥虫病抗原的IgG抗体。这种抗体在感染后4 ~ 6周出现，终生存在。这种方法虽然具有较高的诊断价值，但其滴度与疾病的严重程度无关，也没有证据显示抗体对病程的影响。常用的方法有补体结合试验、间接免疫荧光抗体试验和酶联免疫吸附试验。电镜检查，发现锥虫，有助于诊断。

1.这种方法可用于了解轻度或晚期右心室心内膜心肌活检病例的心肌损伤程度，但通常不会发现锥虫。

2.x线检查可显示巨食管和巨结肠。可发现心脏增大、特殊心尖动脉瘤等体征。