慢性胰腺炎最突出的症状是腹痛。90%以上的患者都有不同程度的腹痛，开始是间歇性的，后来可转为持续性腹痛。性质可以是钝痛、隐痛、钻心痛，甚至是剧痛。多位于中上腹，可左可右，可向背部放射。

当患者坐在屈膝位置时，疼痛可以减轻。另外是胰腺功能不全的表现。慢性胰腺炎晚期，可能出现吸收不良综合征和糖尿病。

由于胰腺外分泌功能障碍，腹胀、食欲不振、恶心、嗳气、厌食、油腻、乏力、消瘦、腹泻甚至脂泻，常伴有维生素a、d、e和维生素K缺乏，患者会出现夜盲症、皮肤粗糙、肌肉无力和出血倾向等。

约一半的慢性胰腺炎患者可因胰腺内分泌功能障碍而发展为糖尿病。