闭经的病因非常复杂，医学界目前也没有给出明确的答案。闭经会涉及下丘脑-垂体-卵巢轴的功能紊乱，甚至引起内分泌器官的病变。因此，在确诊之前，这种疾病往往被误判为功能障碍，从而忽略了可能的病理变化。

性闭经:由子宫内膜对激素无反应或反应低引起。多见于子宫内膜结核、子宫内膜损伤(如刮宫后子宫内股骨再生)、子宫内膜粘连和发育异常等。这类患者即使用人工激素(人工周期)调节子宫内膜也不会脱落出血。

卵巢闭经:主要是卵巢疾病引起的。因为雌激素水平过低，不能促进子宫内膜生长，如先天性卵巢发育不良、卵巢早衰、卵巢反应迟钝等。这些人雌激素水平低，但促性腺激素正常或偏高，可以通过人工周期治疗。

性闭经:闭经与垂体功能不全有关，可见于Sheehan综合征合并颅脑损伤的脑部放疗后。

下丘脑性闭经:问题在于下丘脑可由神经系统器质性疾病引起，如炎症、肿瘤缺血等。也可由精神因素、环境变化、全身性疾病、营养不良、药物作用等引起。

闭经的原因很多，但根据疾病的一些规律和一些常规的全身检查，往往可以确定病因。最后，根据诊断后的一些问题，研究了新的治疗方案。但由于疾病类型的不同，有些闭经要过很久才能确诊，极大地影响了正常生活，所以女性朋友要时刻注意。