临床上应与颗粒细胞瘤、播散性透镜状皮肤纤维化、透明细胞棘皮瘤、黑色素瘤等鉴别。

1.隆突性皮肤纤维肉瘤中有多种细胞成分；细胞核大而略异常，有许多有丝分裂像。进行性增大，直径大于2 ~ 3 cm，提示恶性纤维组织细胞瘤或隆突性皮肤纤维肉瘤，应切除活检。

2.结节性痒疹常发生在肢体的伸展侧，多发，大小均匀，但不会大幅度增加。瘙痒明显无刺痛，常与虫咬有关。组织病理学为表皮疣状或乳头状增生，真皮无胶原纤维和组织细胞增生。

3.皮肤平滑肌瘤类似于皮肤纤维瘤，但很痛苦。组织病理学检查显示肿瘤由纵横交错的光滑纤维束组成。细胞核居中，呈杆状，两端钝圆，肌纤维束间常可见胶原纤维。在HE染色下，这两种纤维不容易区分，但用Verhoeff-van Gieson染色，胶原纤维是红色的，而肌肉是黄色的。如果用Masson三色染色，胶原蛋白是绿色的，而肌肉是暗红色的。

4.该病应与恶性黑色素瘤、结节性黄瘤和瘢痕疙瘩相鉴别。