如果发生人脑动脉深支闭塞，脑干和大脑深部非皮层会出现一些相对较小的梗死灶，这就是腔隙性梗死。腔隙性脑梗死可发生在脑干、壳核或脑桥。其中脑干腔隙性梗死最难治疗，可能导致死亡。腔隙性脑梗死如果梗死面积超过20mm，可称为巨大腔隙性脑梗死。通常，这种腔隙性脑梗死很少见。

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腔隙性脑梗死的病因中，高血压和动脉硬化最为常见，因此腔隙性脑梗死常被归为脑血管疾病。这种病一般长在中年男性或老年男性，可在几天或几小时内突然或逐渐发作。

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腔隙性脑梗死可由多种原因诱发，最常见的是高血压，因为高血压可在一定程度上损伤小动脉或微动脉的动脉壁，可诱发大量血小板不断聚集，从而引起血栓形成，一旦形成血栓，很可能导致脑梗死。

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一些腔隙性脑梗死可能是由动脉硬化引起的，特别是因为脑中的动脉硬化或基底动脉粥样硬化。这种动脉硬化现象可使一些相对较小的血栓堵塞在深部穿支动脉中，从而诱发腔隙性脑梗死。

事实上，腔隙性脑梗死不仅可以由高血压引起，也可以由血压的异常变化引起。比如有的人血压很不稳定，时高时低，可以使动脉比较狭窄的地方血流发生明显变化，从而形成一些比较小的梗塞，可能诱发腔隙性梗塞。