宝宝晚上咳嗽厉害的原因有:

1.与支原体感染有关。典型支原体感染可引起阵发性剧烈咳嗽，白天症状较轻，夜间症状较重，夜间咳嗽症状明显。

2.宝宝晚上剧烈咳嗽也和过敏性咳嗽有关。接触灰尘、冷空气、烟雾、油烟等易诱发过敏性咳嗽，白天或夜间均可出现咳嗽症状，但夜间迷走神经兴奋，更易出现咳嗽症状。

为查明咳嗽原因，建议进行血常规检查、肺部CT检查、X线检查、肺功能检查，并根据检查结果给予治疗。