1.组织病理学检查显示癌细胞呈梭形，细胞核大而深，无细胞间桥和浸润性生长。标本可以通过刮削、切割、针刺和切除来收集。

肿瘤细胞团位于真皮内，与表皮相连。肿瘤酷似表皮基底细胞，但细胞核较大，呈卵圆形或长圆形，细胞质相对较小，细胞边界不清，细胞间无细胞间桥，周围细胞呈网格状排列，边界清晰。肿瘤细胞的细胞核大小、形态和染色相当一致，没有变化。肿瘤周围的结缔组织增生，在肿瘤周围平行成束排列。其中有许多未成熟的成纤维细胞，可见粘液变性。由于粘蛋白在标本固定和脱水过程中收缩，肿瘤周围出现裂缝。这虽然是人为现象，但却是这种疾病的典型表现，有助于与其他肿瘤相区别。

组织学上，基底细胞癌可分为未分化和分化两类。性别分化稍微分化为皮肤附属物，即毛发、皮脂腺和大汗腺或外分泌腺。但是没有明显的界限，因为很多未分化的阶层在某些区域可以表现出一定的分化，而大多数分化的阶层在某些区域缺乏分化。结合临床病变，溃疡性结节可分化或未分化，而色素性、浅表性和纤维上皮瘤性结节常表现为极低分化或未分化。结合临床和组织学分类，所谓的结节性溃疡性基底细胞癌和痣样基底细胞癌综合征、线状单侧基底细胞痣和Bazex综合征可显示分化或未分化，而其他四种基底细胞癌，即硬皮病样、浅表性和纤维上皮瘤性基底细胞癌，往往很少显示分化或未分化。其组织学分类如下:

(1)实性基底细胞癌:又称原始基底细胞癌。它是嵌在真皮内的大小不一、形态各异的肿瘤块。在90%以上的基底细胞癌中，肿瘤块与表面表皮相连，偶尔肿瘤块与外毛根鞘接触。肿瘤周围各层常呈网格状排列，但细胞核无一定模式。

(2)角化型基底细胞癌:又称毛型，除未分化细胞外，还有角化细胞和角化囊肿。角化不良细胞的细胞核较长，胞质略呈嗜酸性，与未分化细胞的深嗜碱性胞质不同。角化不全细胞排列成束，同心螺旋或围绕角囊肿。这些细胞可能是初级毛发角质形成细胞，一些类似于正常毛干角质形成细胞的有核细胞，由完全角质形成细胞组成的角化囊肿代表了毛干的形成。就像毛干的角化一样，角化囊肿的形成是颗粒层细胞的中间阶段。角化型基底细胞癌和毛发上皮瘤都有角化囊肿，所以有时很难区分，要根据临床资料来确定。此外，不应将角化囊肿与鳞状细胞癌的角珠混淆。

(3)囊性基底细胞癌:肿瘤小叶内有一个或数个囊腔，多为肿瘤岛中央肿瘤细胞进行性坏死所致。极少数情况下，瘤岛中央细胞在解体前呈空泡状，提示其分化为皮脂腺。

(4)腺样基底细胞癌:管状腺样结构。细胞排列成交织的条索状，放射状环绕结缔组织岛，使肿瘤呈花边状。

(5)色素性基底细胞癌:银染显示肿瘤细胞团内散在的黑素细胞。这些黑素细胞的胞质和树突中有许多黑色素颗粒。肿瘤往往含有少量黑色素，但在肿瘤块周围的结缔组织间质中有许多黑色素吞噬细胞。

(6)硬皮病样基底细胞癌:这种类型的结缔组织比其他类型的基底细胞癌受累多得多。许多长的脊索瘤细胞群排列并包埋在致密的纤维间质中。大多数细胞索狭窄，通常只有一层厚，类似于乳腺癌转移的甲癌。

(7)浅表性基底细胞癌:这类基底细胞癌的特点是肿瘤组织呈芽状，肿瘤组织不规则增生，附着于表皮。肿瘤周围的细胞通常呈网格状。在大多数情况下，肿瘤组织很少渗透到真皮中，并且覆盖的表皮经常收缩。成纤维细胞往往相当多，排列在肿瘤细胞周围增殖。真皮上部有轻度至中度非特异性慢性炎症浸润。

(8)上皮肿瘤型基底细胞癌:该类型肿瘤细胞呈细长分支索状排列，嵌于纤维间质中，多数与表皮相连，上皮索周围随处可见呈网格状排列的深染细胞。肿瘤位置较浅，有明显的下边界。

2.基底细胞癌细胞角蛋白免疫组化染色阳性。α-2和β1整合素染色也呈阳性，但细胞间粘附分子1(1CAM-1)、白细胞功能抗原la(LFA-la)和血管细胞粘附分子1(VCAM-1)呈阴性。有时肿瘤细胞对HLA-DR抗原呈阳性。大多数肿瘤细胞P53蛋白表达阳性。

x线、CT和MRI有助于估计癌症的范围和侵袭水平。