应与急性化脓性骨髓炎、原发性骨网织细胞肉瘤、神经母细胞瘤骨转移和骨肉瘤相鉴别。

1.急性化脓性骨髓炎是一种急性病，常伴有高热，疼痛比尤因肉瘤更剧烈。化脓常伴有跳痛，夜间疼痛不加重。有些病例伴有胸部或其他感染。早期X线片，患骨变化不明显，随后髓松质骨出现点状稀疏破坏。骨质破坏伴有骨质增生，出现许多死骨。穿刺检查，骨髓炎早期可吸出血性或脓性液体，细菌培养阳性，但尤因肉瘤不阳性。脱落细胞学有助于诊断。骨髓炎抗炎治疗效果明显，尤文肉瘤对放疗极其敏感。

2.骨原发性网织红细胞瘤多发生于30 ~ 40岁，病程长，一般情况良好，临床症状较轻。X线表现为不规则溶骨性骨质破坏，有时融冰，无骨膜反应。病理检查显示细胞核更不规则多形性，网状纤维丰富，围绕肿瘤细胞。组织化学检查:细胞质中的葡萄糖苷原。

3.神经母细胞瘤骨转移多见于5岁以下儿童，60%来自腹膜后，25%来自纵隔，常无明显原发症状。转移部位疼痛肿胀，常见病理性骨折。尿检显示儿茶酚胺升高。x光片往往难以识别；病理性神经母细胞瘤细胞呈梨形，形成真菊花型；电镜下肿瘤细胞内有神经内分泌颗粒。

4.骨肉瘤的临床表现为轻度发热，以疼痛为主，夜间较重。肿瘤穿透皮质骨进入软组织形成的肿块多在骨侧，内部有骨化阴影。骨反应的大小和形态常不一致，常见科德曼三角和桡骨针样改变。在病理学上，肿瘤细胞不是以假菊花模式排列的。