射精后的疼痛被认为是由以下两个因素引起的:

第一，输尿管结石或肾结石。因为性生活时用力过猛，而且里面有结石，会引起肾积水，输尿管扩张，导致肾区反射性疼痛。

第二，也可能是长时间的性生活会导致腰肌劳损，使身体在射精后出现疼痛症状，两者是相互关联的。

经检查，如果是结石，小结石可以服用排石药排出，如果是大结石，则需要进行手术取石。如果有腰肌劳损，可以去中医院做局部按摩或者针灸缓解。