3岁宝宝入睡困难的原因包括生理因素和病理因素。

第一，如果3岁的宝宝是因为环境原因，饮食原因，包括排便，甚至是惊吓或者害怕，会很难入睡，甚至尖叫，惊醒，晚上总是醒。

3岁宝宝已经上幼儿园，或者正在和别人交流。这时候就要和孩子好好沟通，看看有没有相应的问题，并据此解决，这样睡眠困难就会明显缓解。

第二，孩子有病理原因，是胃有问题还是肠道有问题，是发烧还是中枢系统有问题。如果有相关疾病，相应系统的问题也会影响睡眠。这种情况下，如果孩子去医院治疗，找出相关原因，并得到相应的治疗，孩子的睡眠就会明显缓解。

因此，睡眠困难可分为生理性或病理性情况，应进行相应的观察、检查和治疗。