抗甲状腺药物抑制甲状腺合成甲状腺激素，是甲亢的基础治疗。常见的副作用有:

1.粒细胞缺乏症:当中性粒细胞为1。5x109/L，通常不需要停药。需要减少药物用量，增加促进白细胞升高的药物，如鲨肝醇等。

2.皮疹:轻度皮疹可给予抗过敏药物，或改用另一种抗甲状腺药物。在严重的情况下，需要停药。

3.中毒性肝病:抗甲状腺药物治疗前后需要监测肝功能。

4.血管炎:一般随着用药时间的延长，发病率增加。