由于抗菌药物的广泛应用，志贺菌的耐药菌株逐渐增多，常用抗菌药物疗效明显降低。因此，有必要及时做药敏试验进行粪便培养，以检测致病菌，从而指导合理用药。目前，常用的药物有:

(1)磺胺类药。

(2)抗生素:庆大霉素是目前常用的抗生素之一。氨苄青霉素磷霉素。

(3)喹诺酮类。包括吡哌酸、诺氟沙星、氟嗪酸和氟嗪酸。

(4)中药，包括黄连素、穿心莲、消炎。