儿童阴茎疼痛的原因有很多，如包皮龟头炎、泌尿系统疾病等。

1、包皮龟头炎。儿童阴茎疼痛的症状常发生在包茎严重的患者身上。这类患者的包皮内可能会有包皮垢，容易引起包皮龟头发炎，会伴有阴茎疼痛的症状。

2.泌尿系统疾病。如果患者患有尿道炎或膀胱炎，炎症刺激容易导致小儿尿频、尿痛，尤其是排尿时，阴茎疼痛会加重。

当患者出现阴茎疼痛症状时，应先明确具体病因，再进行相应的治疗，治疗效果会更好。