脑栓塞是由于循环栓子随血液进入脑动脉，阻塞血流所致。栓塞多由心脏疾病引起的纤维沉积或血栓脱落引起，尤其是游离脱落的血凝块最为常见。心脏病引起的脑栓塞称为心源性脑栓塞。

有栓子的常见心脏病有:

(1)风湿性心脏病:是心源性脑栓塞的主要病因和来源，占脑栓塞的40%以上。栓塞可发生在急性活动性风湿性心内膜炎或慢性风湿性心瓣膜病中，最常见于二尖瓣狭窄。增厚、肿胀的瓣膜表面出现小赘生物，容易形成血栓，增厚、变形、粗糙的瓣膜上也可出现粘连性血栓。这些血栓脱落后随血流进入大脑，就会发生脑栓塞。风湿性心脏病并发房颤时，左心房附壁血栓更容易脱落，形成栓子。风湿性心脏病多发生在青壮年，因此心源性脑栓塞的发病年龄远低于脑血栓。

(2)心肌梗死:急性心肌梗死时，心内膜常产生附壁血栓，若有凝块脱落进入血液，则成为栓子。这种脑栓塞一般发生在心肌梗死后6周内。

(3)心脏手术:心脏手术引起脑栓塞的发生率为2%~10%，可发生在术中或术后。栓子可以是血凝块或空气栓子。

(4)其他心脏疾病:如细菌性心内膜炎、扩张型心肌病等。，可能有栓子脱落。