发烧和眼睛疼痛的治疗方法有:

首先要治疗原发病，这样才能缓解眼睛的不适。患者也可以在眼睛局部冰敷，或者用流动水冲洗眼睛来缓解症状。

其次，认为与毛细血管扩张有关，或与泪道感染有关，可用非甾体抗炎药治疗。

此外，如果伴有眼部分泌物异常增多，则认为是上呼吸道感染引起的发热可能会引起眼部疼痛。原发病可采用降温药物结合物理降温治疗。

遇到以上情况，建议及时去医院，医生会根据具体情况用药。