男性射精后腰部有疼痛感，根据病因处理:

首先考虑可能是因为性生活时用力不当导致的腰肌劳损。此时注意休息，一般会逐渐缓解，无需特殊处理。

其次，也有可能患者有泌尿系统的炎症感染。这样可以镇定心神，导致患者在射精时出现腰疼的症状。

此外，如果男性患者有输精管炎症或前列腺炎症，这可能会导致射精后腰部疼痛的现象。建议及时进行相关检查，明确具体疾病后再积极对症治疗。