对于亚急性甲状腺炎引起的甲状腺功能减退，一般可出现甲状腺激素分泌减少、皮肤粗糙、尿量减少、经常感到寒冷、乏力等。严重者可出现便秘和心率减慢。在甲状腺功能恢复阶段，大部分患者在短时间内(数周至数月)恢复正常功能，只有少数患者成为永久性甲减。

如果患者会出现永久性甲减，如果甲状腺激素偏低，没有及时发现和治疗，甲减症状会逐渐加重，主要表现为水肿、体重增加、怕冷、冷漠、嗜睡、便秘、心包积液等。，所以需要给予左旋甲状腺素钠片长期治疗。

炎症引起的甲状腺功能变化一般可分为三个时期，即甲亢期、甲减期和恢复期。在甲亢中，50%~75%的患者出现体重减轻、怕热、心动过速等症状。在甲减中，约25%的患者会出现水肿、怕冷、便秘等症状。而当甲状腺激素的合成功能还没有完全恢复时，就会出现甲状腺功能的下降。整个病程约6~12个月。部分患者病情持续恶化，可持续数月至两年。复发率2%~4%，很少有反复发作的。