诊断主要与下列疾病相鉴别:

1.大疱性类天疱疮多见于老年患者。基本损伤为厚壁张力性水泡或血水泡，不易破裂，破裂后也容易愈合。尼氏征为阴性，黏膜损伤罕见。组织病理学检查显示水疱位于表皮下。直接免疫荧光检查显示基底膜中线性C3和IgG沉积。

2.重度多形性红斑可在皮肤和粘膜上出现大疱性病变，常伴有多形性斑疹、丘疹或紫癜，尼氏征阴性，发热，急性起病，早期治疗后迅速恢复。

3.中毒性表皮坏死松解症起病突然，进展迅速，全身症状严重。水疱发生在红斑的基础上，面积较大，疱壁松弛起皱，类似大面积烧伤。尼氏征为阳性。成人多由药物过敏引起，常有用药史。组织病理学和免疫荧光检查可用于鉴别。

4.剥脱性皮炎药疹应与落叶性天疱疮相鉴别。药疹一般发生在发病前服药后3周内。皮疹损害多为麻疹样或猩红热样红斑，逐渐发展为全身皮肤脱皮，起病急，常伴有高热等全身症状。停药后皮疹逐渐减轻，落叶性天疱疮发病缓慢，很少自愈。可以区分组织病理学和免疫荧光。

5.疱疹样皮炎是多形性的，有一组组紧张的绿豆到樱桃大小的厚壁水疱，常见于肩胛骨、骶骨和四肢。尼氏征阴性，瘙痒剧烈，可缓解，但常复发。组织病理学检查显示水疱位于表皮下。直接免疫荧光检查显示真皮乳头颗粒IgA沉积。

除上述疾病外，黏膜天疱疮病变应与口疮性口炎、扁平苔藓、糜烂型红斑狼疮、黏膜良性类天疱疮等鉴别。其他应与天疱疮鉴别的疾病包括获得性大疱性表皮松解症、迟发性皮肤卟啉症等。