阴茎长痘痘有两个原因:

首先要考虑到有阴茎硬结。这种情况下，里面的疙瘩会是阴茎海绵体内的感染因素引起的，患者可能会有疼痛。

第二，要考虑到有尿道炎症。尿道发炎时，容易导致里面形成坚硬的丘疹，从而导致排尿困难、瘙痒、排尿无力等。

因此，建议患者一定要做常规尿道检查、常规阴茎检查或彩色多普勒超声检查，以明确诊断。如果是阴茎硬结，可以选择左氧氟沙星进行治疗，如果有尿道炎症，可以选择青霉素进行治疗。