剖腹产40天后伤口疼痛可能由以下因素引起:

第一，伤口还没有完全恢复。剖腹产后，如果产妇身体虚弱，可能会影响伤口愈合时间，伤口愈合不好时，会出现疼痛症状。

第二，伤口是感染等因素造成的。

剖腹产术后伤口有疼痛感时，建议不要私自使用消炎药或止痛药。应及时就医，查明原因后再采取治疗措施。如果伤口没有完全恢复，可以暂时观察，随着时间的推移伤口会逐渐恢复。