正常月经的建立和维持依赖于下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节、靶器官子宫内膜对性激素的周期性反应以及下生殖道的通畅。任何一个环节出现障碍，都可能导致闭经。

下丘脑性闭经是最常见的闭经，是指中枢神经系统和下丘脑的各种功能性和器质性疾病引起的闭经，主要是功能性原因。常见原因有精神紧张如紧张焦虑、体重下降和神经性厌食、运动性闭经和药物性闭经、颅咽管瘤等。

其次是垂体性闭经，常见的原因有产后出血引起的垂体梗死、垂体瘤、空蝶鞍综合征等。

卵巢闭经的常见原因包括卵巢早衰、卵巢功能性肿瘤、多囊卵巢综合征等。

性闭经多由子宫内膜感染或外伤引起的宫腔粘连引起。