溃疡性结肠炎的病因仍然未知。虽然理论很多，但目前还没有定论。细菌的原因已经排除了，病毒的原因就不一样了，因为这种病是不传染的，病毒颗粒还没有确认。克罗恩病患者血清溶酶体升高，但溃疡性结肠炎患者正常。遗传因素可能有一定的地位，因为白人中犹太人的数量是非犹太人的2 ~ 4倍，而非白人的数量比白人少50%左右。Gilat等人报道溃疡性结肠炎发病率明显降低到3.8/10万，而丹麦哥本哈根为7.3/10万，英国牛津为7.3/10万，美国明尼苏达州为7.2/10万。此外，女性与男性的比例仅为0.8，而其他报告中的比例为1.3。显然，地理和种族的差异影响了这种疾病的发生。心理因素在病情恶化中起着重要作用。现在清楚的是，与匹配的对照病例相比，溃疡性结肠炎患者没有异常诱因。此外，结肠切除术后原有的抑郁或社交距离等病态精神明显改善。认为溃疡性结肠炎是一种自身免疫性疾病，许多患者血液中存在与正常结肠上皮和特异性肠道细菌脂多糖抗原交叉反应的抗体。此外，通过结肠炎患者的血清培养，淋巴细胞可对结肠上皮细胞产生细胞毒性。此外，结肠炎患者的T和B淋巴细胞也发生了变化。

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中药灌肠治疗①湿热证，黄芩15g，黄连10g，秦皮10g，白鲜皮30g，白芍15g，白芨15g，石榴皮15g。②脾虚温热证，黄芪30g、黄连10g、黄芩10g、马齿苋30g、白芨10g、苍术50g、五倍子5g。以上两方水煎50 ~ 100 ml，每晚睡前保留灌肠一次，半个月为一疗程。也可以用锡类散、黄连素、苦参、云南白药、保留灌肠。

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糖皮质激素治疗效果差或不能耐受其副作用时的免疫抑制剂和免疫调节剂，硫唑嘌呤、环磷酰胺、6-MP等。可以选择；近年来应用甲氨蝶呤和环孢素A (10 mg/kg)有时取得了良好的效果，但这些药物有一定的副作用，应慎用。也有报道称青霉胺、左旋咪唑、干扰素、7S-γ球蛋白等。有一定疗效。

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4-氨基水杨酸(4-ASA)，也称为PAS，是一种抗结核药物。用2g溶于100ml水中，保留灌肠，每日一次。治疗8周后，有效率为83%。Ginsberg等人报道4-ASA每天分几次口服4g。治疗12周后，55%的患者疗效良好。4-ASA治疗溃疡的机制仍然未知。

保持适当的营养对溃疡性结肠炎的治疗非常重要。慢性疾病，需要保持充足的营养，尤其是这种疾病。腹痛和发烧会导致厌食和体重减轻。腹泻和直肠出血会导致身体失去液体、营养和电解质。这些物质的平衡对维持人体机能起着重要作用。