虽然口腔溃疡的确切病因尚不清楚，但专家认为口腔溃疡的发生是多种因素共同作用的结果。免疫、遗传和环境可能是口腔溃疡发病中的“三重因素”，即遗传背景和适宜的环境因素(包括精神和神经体质、心理和行为状态、生活、工作和社会环境等。)可引起异常免疫反应，引起口腔溃疡的特征性病变。也有人提出“两因素”学说，即外源性因素(病毒和细菌)和内源性诱发因素(激素变化、心理因素、营养缺乏、全身性疾病和免疫功能障碍)相互作用而致病。

大多数医生认为口腔溃疡与以下因素有关:

1、消化系统疾病和功能障碍

系统性疾病患者容易出现口腔溃疡，主要影响免疫系统。口腔溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎有关。研究表明，30%-48%的口腔溃疡患者有消化道疾病，如腹胀、腹泻或便秘。其中9%以上有消化道溃疡。

2.内分泌变化

部分女性患者常发生在月经期，可能与体内雌激素减少有关。有些女性每次来月经或月经前后都会出现口腔溃疡，只能通过药物治疗暂时缓解。下个月来月经的时候还是会像以前一样出现，疼痛难忍。同时还常伴有口干、心烦、易怒、大便干燥等恼人的症状。临床研究发现，经期口腔溃疡主要是由于孕激素水平升高和雌激素(黄体酮等)减少引起的。).

3.精神因素

部分患者精神紧张，情绪波动，睡眠不好，可能与植物神经功能紊乱有关。

4.遗传因素。

如果父母双方都患有复发性口腔溃疡，其子女约80-90%患病，如果父母一方患有此病，其子女约50-60%患病。

5.其他因素

如缺乏微量元素锌和铁、叶酸、维生素B12和营养不良等。，会降低免疫功能，增加复发性口腔溃疡的可能性。该病毒可能是口腔溃疡的始动因素，但目前尚未在患者血清中发现相关抗体，也没有从口腔溃疡病变组织中分离病毒的报道。细菌在口腔溃疡中的作用已被提出多年，与口腔溃疡密切相关的细菌有血链球菌和幽门螺杆菌[14]。体内超氧自由基的产生和清除速度不平衡，血栓素B2和6-酮-前列腺素的比例不平衡，整体水平下降，可导致口腔溃疡。微循环障碍导致血流缓慢，血流量低，毛细血管静脉端径扩张，缺血缺氧，导致粘膜损伤，溃疡形成。血清缺锌、缺铁、高铜与RAU的发生有关。据报道，戒烟也会诱发口腔溃疡。牙膏中的一种成分12-烷基硫酸钠(SLS)可能会刺激粘膜，诱发口腔溃疡。

6.中医病因机制

口腔溃疡在我国医学界早有记载。根据中医理论体系，口腔溃疡的病因有以下几种:一是外感六邪，主要是燥火，为燥燥，易伤津液，火为阳邪，其性炎向上，灼火伤津液，口疮为发。所以口疮在秋季和气候突变时经常复发。二是饮食不当，由于过食辛辣油腻之品或偏食，导致内生之热，沿经络发作，熏蒸舌体，常耗伤肺肾之阴津，而致口疮。第三，患者情绪状态偏激，患者一直焦虑过度，失眠，五年郁化为火，心火过度，上炎灼舌，或心火下经小肠，沿经络袭口，均可引起口腔生疮。或者平时有生气，肝郁气滞，肝气郁结导致上火，阴血暗耗，导致冲任经络失衡。月经期间，经络气滞更甚，肝火旺盛，口舌生疮。第四，身阴两虚，身阴两虚，或久病阴损，内生虚火，舌苔灼热甚至口舌生疮。五是劳损内伤，或久病伤脾，脾虚、积水、舌苔，导致口疮；或者抑郁久则化热，湿热上蒸也会生口疮。更何况脾气极弱，伤脾阳。脾阳虚、寒湿导致热，口上有色斑可导致口疮。第六，先天伏虚，或长期受寒受寒，伤脾肾，脾肾阳虚，阴寒过盛，舌上寒湿，寒凝血瘀，舌上久疮。总之，外感邪气、六淫燥火、五脏六腑实热是发病的主要原因，主要发病部位是心脾(胃)。

7.食物不耐受

如果口腔溃疡反复发作并持续数年甚至十余年，极有可能与食物不耐受有关。食物不耐受是指一种复杂的过敏性疾病。人的免疫系统将一种或多种进入人体的食物视为有害物质，从而对这些物质产生过度的保护性免疫反应，产生食物特异性IgG抗体。IgG抗体与食物颗粒形成免疫复合物(ⅲ型过敏)，可引起全身组织(包括血管)的炎症反应，表现为全身各系统的症状和疾病。约克营养实验室曾经做过一项研究，调查了2567名疑似食物不耐受的英国人，其中44%的人出现了慢性腹泻、腹痛、溃疡和消化不良。溃疡最主要的表现就是口腔溃疡。可以去医院做食物过敏原筛查(俗称食物不耐受检测)。大中城市的大医院都可以。目前14项常规检查费用在400-500元之间。发现不耐受食物后，不需要吃药。只要调整饮食结构，避免吃这种食物就可以了。彻底摆脱口腔溃疡的困扰，最快30天，最长半年。

8.维生素B群的吸收受阻。

人群中有些人天生就有这种病(有遗传因素)。这些人在正常食物中无法获得足够的B族维生素(一种或多种)，口服相应的B族维生素效果也不明显。这些人的症状是:1。口腔溃疡；2.牙周炎；牙龈萎缩；3.皮肤干燥甚至鱼鳞；4.顽固的脚气；5.饿的时候无法“燃烧”体内脂肪(吃多了会发胖；吃得少，就会饿)；诸如此类。以上症状可能是一种，也可能是两种以上同时出现。很多人的症状在吸烟后消失，戒烟后又重新出现。针对特定症状，定期注射相应的维生素B似乎是有效的。