重症肌无力患者的所有骨骼肌均可受累。然而，眼外肌、喉部肌肉或四肢肌肉的无力可在疾病早期单独出现。受脑神经支配的肌肉比受脊神经支配的肌肉更易受累。患者往往从一个肌肉群的无力开始，逐渐累及其他肌肉群，直至全身无力。

部分患者短时间内出现肌无力甚至肌无力危象。骨骼肌无力的特征是波动和疲劳。早上轻晚上重，运动后加重，休息后缓解。

由外肌无力引起的对称或不对称上睑下垂和/或双眼复视是重症肌无力最常见的首发症状，在80%以上的患者中均有发现。也可能出现交替性上睑下垂、双侧上睑下垂和眼球运动障碍。瞳孔大小正常，对光的反应也正常。

面部肌肉受累可导致鼓腮漏气、眼睑功能不全、鼻唇沟变浅、苦笑或肌病。

咀嚼肌受累可导致咀嚼困难。

肌肉受累、构音障碍、吞咽困难、鼻音、饮水呛咳、声音嘶哑等。

颈部肌肉受累，尤其是屈肌，导致头颈部运动障碍，抬头困难或无力。

肌肉无力可发生在四肢的所有组，通常在近端部分。

呼吸肌无力可引起呼吸困难和虚弱，部分患者可出现肌无力危象，需要人工辅助呼吸。